W oparciu o § 5 umowy o dofinansowanie projektu przyjętej rozporządzeniem Ministra Gospodarki i Pracy z dnia 14 lipca 2005 roku w sprawie wzorów umów o dofinansowanie projektów realizowanych w ramach Zintegrowanego Programu Operacyjnego Rozwoju Regionalnego 2004-2006 (Dz. U. nr 137, poz. 1153 z późn. zm.), oraz z uwagi na zróżnicowanie sposobów prowadzenia rachunkowości przez podmioty gospodarcze, przedstawiane przez beneficjentów dokumenty finansowe dotyczące zakupu nieruchomości powinny uwzględniać i być rozpatrywane w oparciu o gospodarczy charakter poszczególnych beneficjentów, co może oznaczać, że różni beneficjenci będą zobowiązani do przedłożenia różnych dokumentów z uwagi na inny sposób prowadzenia rachunkowości.

Warunki niezbędne do refundacji środków z funduszy strukturalnych odnośnie nieruchomości budynkowych, regulowane są dodatkowo przepisami zasady nr 6 rozporządzenia 448/2004, które to szczegółowo określone są w Wytycznych Ministerstwa Rozwoju Regionalnego w sprawie Kwalifikowalności wydatków w ramach Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego zamieszczonych na stronie internetowej www.kwalifikowalnosc.gov.pl, które należy stosować również do projektów realizowanych w ramach Działania 3,4 Mikroprzedsiębiorstwa ZPORR.