Obowiązek prowadzenia wyodrębnionego rachunku bankowego dla projektu powstaje z dniem podpisania umowy o dofinansowanie projektu. Co do zasady, wydatki poniesione przez Beneficjenta z innych rachunków bankowych można uznać za kwalifikowalne tylko wówczas, gdy zostały dokonane przed dniem zawarcia ww. umowy. Jednakże w stosunku do umów już podpisanych, w uzasadnionych przypadkach wydatki dokonane po podpisaniu umowy z innych rachunków niż wskazany w ww. umowie mogą być uznane za kwalifikowalne, jeśli beneficjent wykaże, iż wydatki te zostały rzeczywiście poniesione na realizację projektu.